Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Padi1Q9Z185 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Padi1Q9Z185 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Padi1Q9Z185 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Padi1Q9Z185 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Padi1Q9Z185 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Padi1Q9Z185 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Padi1Q9Z185 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Padi1Q9Z185 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Padi1Q9Z185 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Padi1Q9Z185 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Padi1Q9Z185 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Padi1Q9Z185 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Padi1Q9Z185 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Padi1Q9Z185 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Padi1Q9Z185 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Padi1Q9Z185 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Padi1Q9Z185 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Padi1Q9Z185 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Padi1Q9Z185 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Padi1Q9Z185 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Padi1Q9Z185 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms