Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ror1Q9Z139 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ror1Q9Z139 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ror1Q9Z139 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ror1Q9Z139 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ror1Q9Z139 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ror1Q9Z139 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ror1Q9Z139 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ror1Q9Z139 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ror1Q9Z139 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ror1Q9Z139 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ror1Q9Z139 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ror1Q9Z139 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ror1Q9Z139 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms