Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema4fQ9Z123 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema4fQ9Z123 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sema4fQ9Z123 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms