Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccl8Q9Z121 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl8Q9Z121 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl8Q9Z121 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl8Q9Z121 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl8Q9Z121 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl8Q9Z121 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl8Q9Z121 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl8Q9Z121 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl8Q9Z121 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccl8Q9Z121 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl8Q9Z121 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl8Q9Z121 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl8Q9Z121 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl8Q9Z121 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl8Q9Z121 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl8Q9Z121 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl8Q9Z121 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl8Q9Z121 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl8Q9Z121 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl8Q9Z121 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccl8Q9Z121 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl8Q9Z121 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl8Q9Z121 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl8Q9Z121 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl8Q9Z121 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl8Q9Z121 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccl8Q9Z121 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms