Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF8

Tusc2, Tumor suppressor candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc2Q9WVF8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tusc2Q9WVF8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Tusc2Q9WVF8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tusc2Q9WVF8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms