Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB6

Clcnkb, Chloride channel protein ClC-Kb, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClcnkbQ9WUB6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ClcnkbQ9WUB6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ClcnkbQ9WUB6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms