Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cul1Q9WTX6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cul1Q9WTX6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms