Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Abcc6Q9R1S7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Abcc6Q9R1S7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Abcc6Q9R1S7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms