Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psma4Q9R1P0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psma4Q9R1P0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psma4Q9R1P0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psma4Q9R1P0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psma4Q9R1P0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psma4Q9R1P0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psma4Q9R1P0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psma4Q9R1P0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Psma4Q9R1P0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psma4Q9R1P0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psma4Q9R1P0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psma4Q9R1P0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Psma4Q9R1P0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psma4Q9R1P0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psma4Q9R1P0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psma4Q9R1P0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psma4Q9R1P0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psma4Q9R1P0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psma4Q9R1P0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psma4Q9R1P0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Psma4Q9R1P0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Psma4Q9R1P0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Psma4Q9R1P0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Psma4Q9R1P0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Psma4Q9R1P0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psma4Q9R1P0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms