Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ntn3Q9R1A3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ntn3Q9R1A3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms