Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0X0

Med20, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med20Q9R0X0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med20Q9R0X0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med20Q9R0X0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms