Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0K7

Atp2b2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b2Q9R0K7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp2b2Q9R0K7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp2b2Q9R0K7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp2b2Q9R0K7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp2b2Q9R0K7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp2b2Q9R0K7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Atp2b2Q9R0K7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atp2b2Q9R0K7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp2b2Q9R0K7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp2b2Q9R0K7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp2b2Q9R0K7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp2b2Q9R0K7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp2b2Q9R0K7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp2b2Q9R0K7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp2b2Q9R0K7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp2b2Q9R0K7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Atp2b2Q9R0K7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atp2b2Q9R0K7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp2b2Q9R0K7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp2b2Q9R0K7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp2b2Q9R0K7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp2b2Q9R0K7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp2b2Q9R0K7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp2b2Q9R0K7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp2b2Q9R0K7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp2b2Q9R0K7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp2b2Q9R0K7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp2b2Q9R0K7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp2b2Q9R0K7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp2b2Q9R0K7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp2b2Q9R0K7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp2b2Q9R0K7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms