Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt71Q9R0H5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms