Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtsfQ9R013 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CtsfQ9R013 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtsfQ9R013 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.4 ms