Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp11cQ9QZW0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp11cQ9QZW0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp11cQ9QZW0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms