Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col4a3Q9QZS0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a3Q9QZS0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms