Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Copg1Q9QZE5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Copg1Q9QZE5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms