Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tomm40Q9QYA2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tomm40Q9QYA2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tomm40Q9QYA2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tomm40Q9QYA2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tomm40Q9QYA2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tomm40Q9QYA2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tomm40Q9QYA2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tomm40Q9QYA2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tomm40Q9QYA2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tomm40Q9QYA2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tomm40Q9QYA2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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