Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcb11Q9QY30 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcb11Q9QY30 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcb11Q9QY30 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms