Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx8Q9QXV1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx8Q9QXV1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms