Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Limd1Q9QXD8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Limd1Q9QXD8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms