Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim44Q9QXA7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim44Q9QXA7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms