Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rai2Q9QVY8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rai2Q9QVY8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms