Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUR6

Prep, Prolyl endopeptidase, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrepQ9QUR6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrepQ9QUR6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrepQ9QUR6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.6 ms