Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlr4Q9QUK6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlr4Q9QUK6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms