Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cln8Q9QUK3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cln8Q9QUK3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms