Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RhoaQ9QUI0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RhoaQ9QUI0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RhoaQ9QUI0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RhoaQ9QUI0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RhoaQ9QUI0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RhoaQ9QUI0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RhoaQ9QUI0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RhoaQ9QUI0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms