Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB8

Cntn6, Contactin-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn6Q9JMB8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cntn6Q9JMB8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cntn6Q9JMB8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms