Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM93

Arl6ip4, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip4Q9JM93 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arl6ip4Q9JM93 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arl6ip4Q9JM93 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arl6ip4Q9JM93 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arl6ip4Q9JM93 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arl6ip4Q9JM93 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arl6ip4Q9JM93 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arl6ip4Q9JM93 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arl6ip4Q9JM93 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arl6ip4Q9JM93 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arl6ip4Q9JM93 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arl6ip4Q9JM93 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arl6ip4Q9JM93 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arl6ip4Q9JM93 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arl6ip4Q9JM93 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arl6ip4Q9JM93 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arl6ip4Q9JM93 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms