Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK3

Cabp5, Calcium-binding protein 5, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp5Q9JLK3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp5Q9JLK3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cabp5Q9JLK3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cabp5Q9JLK3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cabp5Q9JLK3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cabp5Q9JLK3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp5Q9JLK3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp5Q9JLK3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp5Q9JLK3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp5Q9JLK3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp5Q9JLK3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp5Q9JLK3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp5Q9JLK3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp5Q9JLK3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp5Q9JLK3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp5Q9JLK3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cabp5Q9JLK3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cabp5Q9JLK3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cabp5Q9JLK3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cabp5Q9JLK3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms