Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scamp4Q9JKV5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scamp4Q9JKV5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.5 ms