Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx6Q9JKK1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Stx6Q9JKK1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx6Q9JKK1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms