Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl39Q9JKF7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl39Q9JKF7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms