Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trem1Q9JKE2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trem1Q9JKE2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trem1Q9JKE2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms