Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scamp5Q9JKD3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scamp5Q9JKD3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scamp5Q9JKD3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms