Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gfra4Q9JJT2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gfra4Q9JJT2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gfra4Q9JJT2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms