Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smad9Q9JIW5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smad9Q9JIW5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smad9Q9JIW5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms