Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pus3Q9JI38 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pus3Q9JI38 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pus3Q9JI38 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms