Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHX2

Sp5, Transcription factor Sp5, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp5Q9JHX2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp5Q9JHX2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp5Q9JHX2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp5Q9JHX2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp5Q9JHX2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp5Q9JHX2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp5Q9JHX2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sp5Q9JHX2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sp5Q9JHX2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sp5Q9JHX2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sp5Q9JHX2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sp5Q9JHX2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sp5Q9JHX2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sp5Q9JHX2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sp5Q9JHX2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sp5Q9JHX2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sp5Q9JHX2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sp5Q9JHX2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp5Q9JHX2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sp5Q9JHX2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sp5Q9JHX2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sp5Q9JHX2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp5Q9JHX2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp5Q9JHX2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp5Q9JHX2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp5Q9JHX2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp5Q9JHX2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp5Q9JHX2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp5Q9JHX2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp5Q9JHX2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp5Q9JHX2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp5Q9JHX2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp5Q9JHX2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp5Q9JHX2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp5Q9JHX2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp5Q9JHX2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp5Q9JHX2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sp5Q9JHX2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sp5Q9JHX2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp5Q9JHX2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sp5Q9JHX2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp5Q9JHX2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms