Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Exosc9Q9JHI7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Exosc9Q9JHI7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Exosc9Q9JHI7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms