Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET77

Jph3, Junctophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph3Q9ET77 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Jph3Q9ET77 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Jph3Q9ET77 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Jph3Q9ET77 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Jph3Q9ET77 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Jph3Q9ET77 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Jph3Q9ET77 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Jph3Q9ET77 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Jph3Q9ET77 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Jph3Q9ET77 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Jph3Q9ET77 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Jph3Q9ET77 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Jph3Q9ET77 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Jph3Q9ET77 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Jph3Q9ET77 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Jph3Q9ET77 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Jph3Q9ET77 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Jph3Q9ET77 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Jph3Q9ET77 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Jph3Q9ET77 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Jph3Q9ET77 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jph3Q9ET77 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms