Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc4Q9ES56 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trappc4Q9ES56 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc4Q9ES56 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms