Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr61Q9ERF3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr61Q9ERF3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr61Q9ERF3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr61Q9ERF3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr61Q9ERF3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr61Q9ERF3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr61Q9ERF3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Wdr61Q9ERF3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Wdr61Q9ERF3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms