Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Clstn2Q9ER65 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Clstn2Q9ER65 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Clstn2Q9ER65 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Clstn2Q9ER65 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms