Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPT1

Vmn1r63, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r63Q9EPT1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r63Q9EPT1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r63Q9EPT1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r63Q9EPT1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r63Q9EPT1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r63Q9EPT1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r63Q9EPT1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r63Q9EPT1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r63Q9EPT1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r63Q9EPT1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r63Q9EPT1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r63Q9EPT1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r63Q9EPT1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r63Q9EPT1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r63Q9EPT1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r63Q9EPT1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r63Q9EPT1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r63Q9EPT1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r63Q9EPT1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r63Q9EPT1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r63Q9EPT1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r63Q9EPT1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r63Q9EPT1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r63Q9EPT1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms