Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgap1Q9EPJ9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgap1Q9EPJ9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgap1Q9EPJ9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgap1Q9EPJ9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arfgap1Q9EPJ9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgap1Q9EPJ9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgap1Q9EPJ9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms