Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc54Q9DAL3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc54Q9DAL3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc54Q9DAL3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms