Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc89Q9DA73 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc89Q9DA73 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.6 ms