Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9W1

Pifo, Protein pitchfork, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PifoQ9D9W1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PifoQ9D9W1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PifoQ9D9W1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PifoQ9D9W1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PifoQ9D9W1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PifoQ9D9W1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PifoQ9D9W1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PifoQ9D9W1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PifoQ9D9W1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PifoQ9D9W1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PifoQ9D9W1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PifoQ9D9W1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PifoQ9D9W1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PifoQ9D9W1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PifoQ9D9W1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PifoQ9D9W1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PifoQ9D9W1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PifoQ9D9W1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PifoQ9D9W1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PifoQ9D9W1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PifoQ9D9W1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PifoQ9D9W1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PifoQ9D9W1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PifoQ9D9W1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms