Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D9S1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D9S1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D9S1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D9S1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Q9D9S1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9D9S1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9D9S1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q9D9S1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9D9S1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9D9S1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D9S1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D9S1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D9S1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D9S1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9S1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms